Текущая структура «СИБИНТЕК» включает в себя семь крупных центров региональной поддержки:

• филиал «Макрорегион Центр»;
• филиал «Макрорегион Поволжье»;
• филиал «Макрорегион Западная Сибирь»;
• филиал «Макрорегион Восточная Сибирь»;
• филиал «Макрорегион Дальний Восток»;
• филиал «Макрорегион Юг»;
• филиал «Макрорегион Урал».

Центральный Аппарат Общества базируется в Москве.